List of publications / presentations

原著論文 / Original papers
  • Gerhard Jung, Rinske M. Alkemade, Victor Bapst, Daniele Coslovich, Laura Filion, François P. Landes, Andrea J. Liu, Francesco Saverio Pezzicoli, Hayato Shiba, Giovanni Volpe, Francesco Zamponi,  Ludovic Berthier, and Giulio Biroli
    "Roadmap on machine learning glassy liquids"
    arXiv:2311.11452 (2023)
    Public Dataset:  "GlassBench" on Zenodo.
国内学会・研究会講演  /  Domestic Conference Presentations
  • [Invited]  芝 隼人
    「ガラスとグラフニューラルネットワーク  ー 究極の長時間ダイナミクスへのデータ駆動科学への挑戦」
    Supercomputing Japan 2024 2024年3月12日(タワーホール船堀、東京都江東区)
原著論文 / Original papers 国際会議論文 / Conference papers 国際会議講演 / International Conference Presentations 
  • [Invited] Hayato Shiba, Masatoshi Hanai, Toyotaro Suzumura, Takeshi Kawasaki, and Takashi Shimokawabe
    "Deep learning glasses: how well neural network models can capture the dynamic heterogeneity?" 9th International Discussion Meeting on Relaxations in Complex Systems (9IDMRCS)
    13th, Aug. 2023    (Makuhari Messe, Chiba, Japan)
  • [Oral] Hayato Shiba, Masatoshi Hanai, Toyotaro Suzumura, and Takashi Shimokawabe
    "Enhancing the predictive power of static structure in glassy systems by machine learning relative motion" 7th International Soft Matter Conference
    6th Sep. 2023  (Osaka International Convention Center, Osaka, Japan)
  • [Poster] Hayato Shiba, Masatoshi Hanai, Toyotaro Suzumura, and Takashi Shimokawabe
    "Enhancing the predictive power of static structure in glassy systems by machine learning relative motion" 28th International Conference on Statistical Physics (STATPHYS28) 
    13th Aug. 2023  (Hongo Campus, The University of Tokyo, Tokyo, Japan)
  • [Poster]  Hayato Shiba, Masatoshi Hanai, Toyotaro Suzumura, and Takashi Shimokawabe
    "Enhancing the predictive power of static structure in glassy systems by machine learning relative motion" 
    34th IUPAP Conference on Computational Physics (CCP2023)
    6th Aug. 2023  (Kobe International Conference Center, Kobe Port Island, Kobe, Japan
国内学会・研究会講演  /  Domestic Conference Presentations
  • [Invited]  芝 隼人
    ガラス動力学の深層学習  —   乱雑構造の中に隠れた未来を掘り起こす
    STEシミュレーション研究会:計算科学とデータ科学の融合に向けて
    2023年12月20日(神戸大学六甲山キャンパス, 神戸市灘区
  • [Oral]  Hayato Shiba
    "Deep learning of simulated glassy dynamics "
    45th ASE Seminar Advanced Supercomputing Environment): International Workshop on "Integration of Simulation/Data/Learning and Beyond" 
    2023年11月29日(東京大学情報基盤センター,  千葉県柏市)[オンライン講演での参加]
  • [Oral]  芝 隼人
    ガラス動力学の深層学習 ー 現在とその次?
    液体・ガラスへのデータ駆動アプローチ   - グラフニューラルネットワークとその周辺 -
    2023年11月28日(ニチイ学館 神戸ポートアイランドセンター, 神戸市中央区)
  • [Poster] 芝 隼人、下川辺  隆史
    ガラス動力学の深層学習における準安定構造の使用の影響
    第 37 回分子シミュレーション討論会 
    2023年12月5日(福井県県民ホール AOSSA、福井市)
  • [Poster] 芝 隼人
    グラフニューラルネットワークを用いた非晶質系動力学予測システム開発 ー材料シミュレーションの究極的な未来予測モデルに向けてー
    兵庫県立大学 知の交流シンポジウム2023
    2023年9月22日(神戸商工会議所会館、神戸市中央区
セミナー等講演 / Seminar and Lectures
  • [Invited]  芝 隼人
    非晶質材料への深層学習からのアプローチ ー AI 時代の新たなシミュレーションのあり方を探る」
    電気学会   磁気センサとAI 技術を活用したセンシングシステム調査専門委員会(第2回)
    2023年10月31日(Zoom, オンライン開催
  • [Invited]  芝 隼人
    ガラスの長時間分子動力学シミュレーションの深層学習
    第30回AT研究会オープンアカデミックセッション(ATOS30) 
    2023年10月27日(山梨大学 甲府東キャンパス, 甲府)
  • [Invited]  芝 隼人
    ガラスの深層学習 ー シミュレーションとデータサイエンスの新たな出会い、そして可能性
    KOBE HPCサマースクール(初級)2023
    2023年9月19日(神戸大学統合研究拠点, 神戸
原著論文 / Original papers 国際会議録 / International Conference Proceedings 和文記事 / Articles in Japanese
  • Hayato Shiba, Takeshi Kawasaki and Kang Kim
    "Local Density Fluctuation Governs the Divergence of Viscosity Underlying Elastic and Hydrodynamic Anomalies in a 2D Glass-Forming Liquid"
    Physical Review Letters 123, 265501 (2019).
  • Hailong Peng, Momoji Kubo, and Hayato Shiba
    "Molecular dynamics study of mesophase transitions upon annealing of imidazolium-based ionic liquids with long-alkyl chains"
    Physical Chemistry Chemical Physics 20, 9796-9805 (2018). 
    [selected for "2018 PCCP HOT Articles"] 
  • Hayato Shiba, Peter Keim, and Takeshi Kawasaki
    "Isolating long-wavelength fluctuation from structural relaxation in two-dimensional glass: cage-relative displacement"
    Journal of Physics: Condensed Matter 30, 094004/1-9 (2018). 
  • Hideyuki Mizuno, Hayato Shiba, and Atsushi Ikeda
    "Continuum limit of the vibrational properties of amorphous solids"
    Proceedings of the National Academy of Sciences U.S.A. 114, E9767-E9774 (2017).  
  • Hayato Shiba, Yasunori Yamada, Takeshi Kawasaki, and Kang Kim
    "Unveiling Dimensionality Dependence of Glassy Dynamics: 2D Infinite Fluctuation Eclipses Inherent Structural Relaxation"
    Physical Review Letters 117, 245701/1-6 (2016). 
  • John J, Molina, Kotaro Otomura, Hayato Shiba, Hideki Kobayashi, Masaki Sano, and Ryoichi Yamamoto
    "Rheological evaluation of colloidal dispersions using the smoothed profile method: formulation and applications"
    Journal of Fluid Mechanics 792, 590-619 (2016). 
  • Hayato Shiba, Hiroshi Noguchi, and Jean-Baptiste Fournier 
    "Monte Carlo study of the frame, fluctuation, and internal tensions of fluctuating membranes with fixed area"
    Soft Matter 12, 2372-2380 (2016).  [Open Access] 
  • Hayato Shiba and Takeshi Kawasaki
    "Spatiotemporal heterogeneity of local free volumes in highly supercooled liquid"
    The Journal of Chemical Physics 139, 184502/1-8 (2013).  
  • Hao Wu, Hayato Shiba, and Hiroshi Noguchi
    "Mechanical Properties and microdomain separation of fluid membranes with anchored polymers"
    Soft Matter 9, 9907-9917 (2013).      [Open Access] 
  • Hayato Shiba, Hiroshi Noguchi, and Gerhard Gompper
    "Structure formation of surfactant membranes under shear flow"
    The Journal of Chemical Physics 139, 014702/1-11 (2013). 
  • Hayato Shiba, Takeshi Kawasaki, and Akira Onuki
    "Relationship between bond-breakage correlations and four-point correlations in heterogeneous glassy dynamics: Configuration changes and vibration modes"
    Physical Review E 86, 041504/1-14 (2012).     [Erratum: ibid. 95, 069901 (2017).]
  • Hayato Shiba and Hiroshi Noguchi
    "Estimation of the bending rigidity and spontaneous curvature of fluid membranes in simulations"
    Physical Review E 84, 031926/1-13 (2011). 
  • Hayato Shiba and Akira Onuki
    "Plastic deformations in crystal, polycrystal, and glass in binary mixtures under shear: Collective yielding"
    Physical Review E 81, 051501/1-15 (2010).  
  • Hayato Shiba, Akira Onuki, and Takeaki Araki
    "Structural and dynamical heterogeneities in two-dimensional melting"
    EPL 86, 66004/1-6 (2009). 
  • Hayato Shiba and Nobuyasu Ito
    "Anomalous Heat Conduction in Three-Dimensional Nonlinear Lattices"
    Journal of the Physical Society of Japan 77, 054006/1-8 (2008). 
  • Toshiyuki Hamanaka, Hayato Shiba, and Akira Onuki
    "Plastic flow in polycrystal states in a binary mixture"
    Physical Review E 77, 042501/1-4 (2008).  
  • Hayato Shiba, Jori E. Ruppert-Felsot, Yoshiki Takahashi, Yoshihiro Murayama, Qi Ouyang, and Masaki Sano
    "Elastic Convection in Vibrated Viscoplastic Fluids"
    Physical Review Letters 98, 044501/1-4 (2007). 
  • Hayato Shiba, Satoshi Yukawa, and Nobuyasu Ito
    "Divergent Thermal Conductivity in Three-Dimensional Nonlinear Lattices"
    Journal of the Physical Society of Japan 75, 103001/1-4 (2006).