本研究科は、今まさに急速に社会全体に広がりつつある情報科学技術とDX（デジタルトランスフォーメーション）の波を先取りする形で2004年4月に、政策経営情報科学コースおよびヘルスケア情報科学コースからなる独立した情報系大学院としてスタートしました。2011年4月には、情報セキュリティやリスクアセスメントなどの基盤技術や企業や医療などの実際の社会情報システムにおける安全性・信頼性を高めるための教育研究を推進すべく、新たに高信頼情報科学コースを設置しました。